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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2k6vA_ | PDB header: electron transport | Chain: A: PDB Molecule: putative cytochrome c oxidase assembly protein; | PDBTitle: solution structures of apo sco1 protein from thermus2 thermophilus |
Added to library: Tue Mar 16 13:29:29 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | M | H | T | F | Y | G | T | R | L | L | N | P | K | P | V | D | F | A | L | E | G | P | Q | G | P | V | R | L | S | Q | F | Q | D | K | V | V | L | L | F | F | G | F | T | R | C | P | D | V | C | P | T | T | L | L | A | L | K | R | A | Y | E | K | L | P | P | K | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | R | V | Q | V | I | F | V | S | V | D | P | E | R | D | P | P | E | V | A | D | R | Y | A | K | A | F | H | P | S | F | L | G | L | S | G | S | P | E | A | V | R | E | A | A | Q | T | F | G | V | F | Y | Q | K | S | Q | Y | R | G | P | G | E | Y | L | V | D | H | T | A | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | F | V | V | K | E | G | R | L | V | L | L | Y | S | P | D | K | A | E | A | T | D | R | V | V | A | D | L | Q | A | L | L | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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