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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2jlkA_ | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: neural cell adhesion molecule 2; | PDBTitle: crystal structure of ncam2 igiv-fn3i |
Added to library: Sun Aug 29 04:28:58 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | P | H | I | I | Q | L | K | N | E | T | T | Y | E | N | G | Q | V | T | L | V | C | D | A | E | G | E | P | I | P | E | I | T | W | K | R | A | V | D | G | F | T | F | T | E | S | L | D | G | R | I | E | V | K | G | Q | H | G | S | S | S | L | H | I | K | D | V | K | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | B | S | S | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | S | G | R | Y | D | C | E | A | A | S | R | I | G | G | H | Q | K | S | M | Y | L | D | I | E | Y | A | P | K | F | I | S | N | Q | T | I | Y | Y | S | W | E | G | N | P | I | N | I | S | C | D | V | K | S | N | P | P | A | S | I | H | W | R | R | D | K | L | V | L | P | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | N | T | T | N | L | K | T | Y | S | T | G | R | K | M | I | L | E | I | A | P | T | S | D | N | D | F | G | R | Y | N | C | T | A | T | N | H | I | G | T | R | F | Q | E | Y | I | L | A | L | A | D | V | P | S | S | P | Y | G | V | K | I | I | E | L | S | Q | T | T | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | V | S | F | N | K | P | D | S | H | G | G | V | P | I | H | H | Y | Q | V | D | V | K | E | V | A | S | E | I | W | K | I | V | R | S | H | G | V | Q | T | M | V | V | L | N | N | L | E | P | N | T | T | Y | E | I | R | V | A | A | V | N | G | K | G | Q | G | D | Y | S | K | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | I | F | Q | T | L | P | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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