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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2j8qB_ | PDB header: nuclear protein | Chain: B: PDB Molecule: cleavage and polyadenylation specificity factor | PDBTitle: crystal structure of human cleavage and polyadenylation2 specificity factor 5 (cpsf5) in complex with a sulphate3 ion. |
Added to library: Tue Mar 16 12:53:16 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | P | L | T | L | E | R | T | I | N | L | Y | P | L | T | N | Y | T | F | G | T | K | E | P | L | Y | E | K | D | S | S | V | A | A | R | F | Q | R | M | R | E | E | F | D | K | I | G | M | R | R | T | V | E | G | V | L | I | V | H | E | H | R | L | P | H | V | L | L | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | G | G | G | S | S | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | T | T | F | F | K | L | P | G | G | E | L | N | P | G | E | D | E | V | E | G | L | K | R | L | M | T | E | I | L | G | R | Q | D | D | W | V | I | D | D | C | I | G | N | W | W | R | P | N | F | E | P | P | Q | Y | P | Y | I | P | A | H | I | T | K | P | K | E | H | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . |
Sequence | K | L | F | L | V | Q | L | Q | E | K | A | L | F | A | V | P | K | N | Y | K | L | V | A | A | P | L | F | E | L | Y | D | N | A | P | G | Y | G | P | I | I | S | S | L | P | Q | L | L | S | R | F | N | F | I | Y | N | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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