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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2j8kA_ | PDB header: toxin | Chain: A: PDB Molecule: np275-np276; | PDBTitle: structure of the fusion of np275 and np276, pentapeptide2 repeat proteins from nostoc punctiforme |
Added to library: Tue Mar 16 12:51:59 2010 | |
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Sequence | V | P | R | G | S | H | M | D | V | E | K | L | R | Q | L | Y | A | A | G | E | R | D | F | S | I | V | D | L | R | G | A | V | L | E | N | I | N | L | S | G | A | I | L | H | G | A | M | L | D | E | A | N | L | Q | Q | A | N | L | S | R | A | D | L | S | G | A | T | L | N | G |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | D | L | R | G | A | N | L | S | K | A | D | L | S | D | A | I | L | D | N | A | I | L | E | G | A | I | L | D | E | A | V | L | N | Q | A | N | L | K | A | A | N | L | E | Q | A | I | L | S | H | A | N | I | R | E | A | D | L | S | E | A | N | L | E | A | A | D | L | S | G |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . |
Sequence | A | D | L | A | I | A | D | L | H | Q | A | N | L | H | Q | A | A | L | E | R | A | N | L | T | G | A | N | L | E | D | A | N | L | E | G | T | I | L | E | G | G | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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