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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2it3B_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: B: PDB Molecule: upf0130 protein ph1069; | PDBTitle: structure of ph1069 protein from pyrococcus horikoshii |
Added to library: Tue Mar 16 14:20:59 2010 | |
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Sequence | X | R | F | T | E | N | F | E | R | A | K | K | E | A | L | X | S | L | E | I | A | L | R | K | G | E | V | D | E | D | I | I | P | L | L | K | K | I | N | S | I | E | N | Y | F | T | T | S | S | C | S | G | R | I | S | V | X | E | X | P | H | F | G | D | K | V | N | A | K | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | G | K | W | H | R | E | V | S | L | Y | E | V | L | E | A | I | K | K | H | R | S | G | Q | L | W | F | L | V | R | S | P | I | L | H | V | G | A | K | T | L | E | D | A | V | K | L | V | N | L | A | V | S | C | G | F | K | Y | S | N | I | K | S | I | S | N | K | K | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | |
Sequence | V | E | I | R | S | T | E | R | X | D | V | L | L | G | E | N | G | E | I | F | V | G | E | E | Y | L | N | K | I | V | E | I | A | N | D | Q | X | R | R | F | K | E | K | L | K | R | L | E | S | K | I | N | A | L | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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