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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ia0A_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: putative hth-type transcriptional regulator | PDBTitle: transcriptional regulatory protein pf0864 from pyrococcus2 furiosus a member of the asnc family (pf0864) |
Added to library: Tue Mar 16 12:28:51 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | L | D | D | L | D | R | N | I | L | R | L | L | K | K | D | A | R | L | T | I | S | E | L | S | E | Q | L | K | K | P | E | S | T | I | H | F | R | I | K | K | L | Q | E | R | G | V | I | E | R | Y | T | I | I | L | G | E | Q | L | K | P | K | H | L | A | L | I | V | L | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | K | P | E | D | F | L | E | R | Y | I | S | Y | I | S | S | T | L | S | A | L | P | G | V | L | F | V | A | K | S | G | E | D | K | I | I | A | L | V | G | K | N | N | K | D | E | L | V | K | F | I | E | E | N | I | T | S | I | P | N | L | K | H | I | Q | I | F | P | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | E | I | K | K | G | E | D | L | T | G | F | L | A | E | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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