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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2i38A_ | PDB header: rna binding protein/chimera | Chain: A: PDB Molecule: fusion protein consists of immunoglobin g- | PDBTitle: solution structure of the rrm of srp20 |
Added to library: Tue Mar 16 12:41:35 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | Y | K | L | I | L | N | G | K | T | L | K | G | E | T | T | T | E | A | V | D | A | A | T | A | E | K | V | F | K | Q | Y | A | N | D | N | G | V | D | G | E | W | T | Y | D | D | A | T | K | T | F | T | V | T | E | G | S | H | H | H | H | H | H | M | H | R | D | S | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | B | S | B | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | L | D | C | K | V | Y | V | G | N | L | G | N | N | G | N | K | T | E | L | E | R | A | F | G | Y | Y | G | P | L | R | S | V | W | V | A | R | N | P | P | G | F | A | F | V | E | F | E | D | P | R | D | A | A | D | A | V | R | D | L | D | G | R | T | L | C | G | C | R | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | S | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | R | V | E | L | S | N | G | E | K | R | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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