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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2hpkA_ | PDB header: luminescent protein | Chain: A: PDB Molecule: photoprotein berovin; | PDBTitle: crystal structure of photoprotein berovin from beroe2 abyssicola |
Added to library: Tue Mar 16 12:57:21 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | R | L | N | E | Q | N | N | E | S | Y | R | Y | L | R | S | V | G | N | Q | W | Q | F | N | S | R | L | Y | K | R | F | D | T | F | D | L | D | S | D | G | K | X | E | X | D | E | V | L | Y | W | P | D | R | X | R | Q | L | V | N | A | T | D | E | Q | V | E | K | X | R | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | V | R | V | F | F | L | H | K | G | V | E | P | V | N | G | L | L | R | E | D | W | V | E | A | N | R | V | F | A | E | A | E | R | E | R | E | R | R | G | E | P | S | L | I | A | L | L | S | N | S | Y | Y | D | V | L | D | D | D | G | D | G | T | V | D | V | D | E | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | T | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | |||||||||
Sequence | T | X | X | K | A | F | D | V | P | Q | E | A | A | Y | T | F | F | E | K | A | D | T | D | K | S | G | K | L | E | R | T | E | L | V | H | L | F | R | K | F | W | X | ||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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