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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2hjsA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: usg-1 protein homolog; | PDBTitle: the structure of a probable aspartate-semialdehyde2 dehydrogenase from pseudomonas aeruginosa |
Added to library: Tue Mar 16 14:28:34 2010 | |
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Sequence | Q | P | L | N | V | A | V | V | G | A | T | G | S | V | G | E | A | L | V | G | L | L | D | E | R | D | F | P | L | H | R | L | H | L | L | A | S | A | E | S | A | G | Q | R | X | G | F | A | E | S | S | L | R | V | G | D | V | D | S | F | D | F | S | S | V | G | L | A | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | A | A | A | E | V | S | R | A | H | A | E | R | A | R | A | A | G | C | S | V | I | D | L | S | G | A | L | E | P | S | V | A | P | P | V | X | V | S | V | N | A | E | R | L | A | S | Q | A | A | P | F | L | L | S | S | P | C | A | V | A | A | E | L | C | E | V | L | A | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | G | G | G | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | L | A | T | L | D | C | R | Q | L | N | L | T | A | C | L | S | V | S | S | L | G | R | E | G | V | K | E | L | A | R | Q | T | A | E | L | L | N | A | R | P | L | E | P | R | L | F | D | R | Q | I | A | F | N | L | L | A | Q | V | G | A | V | D | A | E | G | H | S | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | T | T | B | S | S | S | S | B | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | R | R | I | F | A | E | V | Q | A | L | L | G | E | R | I | G | P | L | N | V | T | C | I | Q | A | P | V | F | F | G | D | S | L | S | V | T | L | Q | C | A | E | P | V | D | L | A | A | V | T | R | V | L | D | A | T | K | G | I | E | W | V | G | E | G | D | Y | P | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | B | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . |
Sequence | V | G | D | A | L | G | Q | D | E | T | Y | V | G | R | V | R | A | G | Q | A | D | P | C | Q | V | N | L | W | I | V | S | D | N | V | R | K | G | A | A | L | N | A | V | L | L | G | E | L | L | I | K | H | Y | L | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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