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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2gxqA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: heat resistant rna dependent atpase; | PDBTitle: hera n-terminal domain in complex with amp, crystal form 1 |
Added to library: Tue Mar 16 12:03:06 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | E | F | K | D | F | P | L | K | P | E | I | L | E | A | L | H | G | R | G | L | T | T | P | T | P | I | Q | A | A | A | L | P | L | A | L | E | G | K | D | L | I | G | Q | A | R | T | G | T | G | K | T | L | A | F | A | L | P | I | A | E | R | L | A | P | S | Q | E | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | R | K | P | R | A | L | V | L | T | P | T | R | E | L | A | L | Q | V | A | S | E | L | T | A | V | A | P | H | L | K | V | V | A | V | Y | G | G | T | G | Y | G | K | Q | K | E | A | L | L | R | G | A | D | A | V | V | A | T | P | G | R | A | L | D | Y | L | R | Q | G | V | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | D | L | S | R | V | E | V | A | V | L | D | E | A | D | E | M | L | S | M | G | F | E | E | E | V | E | A | L | L | S | A | T | P | P | S | R | Q | T | L | L | F | S | A | T | L | P | S | W | A | K | R | L | A | E | R | Y | M | K | N | P | V | L | I | N | V | I | ||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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