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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2gi7B_ | PDB header: blood clotting, cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: gpvi protein; | PDBTitle: crystal structure of human platelet glycoprotein vi (gpvi) |
Added to library: Tue Mar 16 13:23:11 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | Q | S | G | P | L | P | K | P | S | L | Q | A | L | P | S | S | L | V | P | L | E | K | P | V | T | L | R | C | Q | G | P | P | G | V | D | L | Y | R | L | E | K | L | S | S | S | R | Y | Q | D | Q | A | V | L | F | I | P | A | M | K | R | S | L | A | G | R | Y | R | C | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | Q | N | G | S | L | W | S | L | P | S | D | Q | L | E | L | V | A | T | G | V | F | A | K | P | S | L | S | A | G | D | V | T | L | Q | C | Q | T | R | Y | G | F | D | Q | F | A | L | Y | K | E | G | E | R | W | Y | R | A | S | F | P | I | I | T | V | T | A | A | H | S | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | T | Y | R | C | Y | S | F | S | S | R | D | P | Y | L | W | S | A | P | S | D | P | L | E | L | V | V | T | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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