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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ft3B_ | PDB header: structural protein, signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: biglycan; | PDBTitle: crystal structure of the biglycan dimer core protein |
Added to library: Tue Mar 16 13:19:07 2010 | |
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Sequence | A | M | C | P | F | G | C | H | C | H | L | R | V | V | Q | C | S | D | L | G | L | K | A | V | P | K | E | I | S | P | D | T | T | L | L | D | L | Q | N | N | D | I | S | E | L | R | K | D | D | F | K | G | L | Q | H | L | Y | A | L | V | L | V | N | N | K | I | S | K | I | H |
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SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() | T | T | T | T | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | ![]() | ![]() |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | K | A | F | S | P | L | R | K | L | Q | K | L | Y | I | S | K | N | H | L | V | E | I | P | P | N | L | P | S | S | L | V | E | L | R | I | H | D | N | R | I | R | K | V | P | K | G | V | F | S | G | L | R | N | M | N | C | I | E | M | G | G | N | P | L | E | N | S | G | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | S | S | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T | T | S | S | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | P | G | A | F | D | G | L | K | L | N | Y | L | R | I | S | E | A | K | L | T | G | I | P | K | D | L | P | E | T | L | N | E | L | H | L | D | H | N | K | I | Q | A | I | E | L | E | D | L | L | R | Y | S | K | L | Y | R | L | G | L | G | H | N | Q | I | R | M | I | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | S | L | S | F | L | P | T | L | R | E | L | H | L | D | N | N | K | L | S | R | V | P | A | G | L | P | D | L | K | L | L | Q | V | V | Y | L | H | T | N | N | I | T | K | V | G | V | N | D | F | C | P | V | G | F | G | V | K | R | A | Y | Y | N | G | I | S | L | F | N | N |
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | S | S | B | T | T | G | G | G | T | T | ![]() | ![]() | ![]() | T | T | S | B | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | ![]() | ![]() | ![]() | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | ||||
Sequence | P | V | P | Y | W | E | V | Q | P | A | T | F | R | C | V | T | D | R | L | A | I | Q | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | ![]() | ![]() |
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