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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2fd4A_ | PDB header: ligase | Chain: A: PDB Molecule: avirulence protein avrptob; | PDBTitle: crystal structure of avrptob (436-553) |
Added to library: Tue Mar 16 13:05:15 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | L | A | A | L | D | P | I | A | S | Q | F | S | Q | L | R | T | I | S | K | A | L | G | F | K | D | A | A | D | D | V | T | H | C | L | F | G | G | E | L | S | L | S | N | P | D | Q | Q | V | I | G | L | A | G | N | P | T | D | T | S | Q | P | Y | S | D | L | A | F | M | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | G | S | B | T | T | S | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | M | K | K | L | A | Q | F | L | A | G | K | P | E | H | P | M | T | R | E | T | L | N | A | E | N | I | A | K | Y | A | F | R | I | V | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | T | B | S | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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