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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2fboJ_ | PDB header: immune system | Chain: J: PDB Molecule: variable region-containing chitin-binding | PDBTitle: crystal structure of the two tandem v-type regions of vcbp32 (v-region-containing chitin binding protein) to 1.85 a |
Added to library: Tue Mar 16 14:01:33 2010 | |
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Sequence | S | I | M | T | V | R | T | T | H | T | E | V | E | V | H | A | G | G | T | V | E | L | P | C | S | Y | Q | L | A | N | D | T | Q | P | P | V | I | S | W | L | K | G | A | S | P | D | R | S | T | K | V | F | K | G | N | Y | N | W | Q | G | E | G | L | G | F | V | E | S | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | B | T | T | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | K | E | S | F | G | D | F | L | G | R | A | S | V | A | N | L | A | A | P | T | L | R | L | T | H | V | H | P | Q | D | G | G | R | Y | W | C | Q | V | A | Q | W | S | I | R | T | E | F | G | L | D | A | K | S | V | V | L | K | V | T | G | H | T | P | S | N | N | V | H | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | T | A | E | V | V | Q | V | D | E | G | N | D | I | T | M | T | C | P | C | T | D | C | A | N | A | N | V | T | W | Y | T | G | P | T | F | F | E | N | Y | E | T | G | T | Y | Q | P | L | A | N | K | N | Q | F | G | I | T | W | F | S | S | E | I | A | G | R | A | S | F | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | |||||||||
Sequence | G | A | R | N | L | V | I | R | A | A | K | I | T | D | A | G | R | V | W | C | E | L | A | T | G | Q | G | E | L | D | A | D | R | S | S | T | I | L | K | V | ||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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