|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2f33A_ | PDB header: metal binding protein | Chain: A: PDB Molecule: calbindin; | PDBTitle: nmr solution structure of ca2+-loaded calbindin d28k |
Added to library: Tue Mar 16 14:04:01 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | A | E | S | H | L | Q | S | S | L | I | T | A | S | Q | F | F | E | I | W | L | H | F | D | A | D | G | S | G | Y | L | E | G | K | E | L | Q | N | L | I | Q | E | L | L | Q | A | R | K | K | A | G | L | E | L | S | P | E | M | K | T | F | V | D | Q | Y | G | Q | R | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | B | S | T | T | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | K | I | G | I | V | E | L | A | H | V | L | P | T | E | E | N | F | L | L | L | F | R | C | Q | Q | L | K | S | C | E | E | F | M | K | T | W | R | K | Y | D | T | D | H | S | G | F | I | E | T | E | E | L | K | N | F | L | K | D | L | L | E | K | A | N | K | T | V | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | T | T | G | G | G | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | T | K | L | A | E | Y | T | D | L | M | L | K | L | F | D | S | N | N | D | G | K | L | E | L | T | E | M | A | R | L | L | P | V | Q | E | N | F | L | L | K | F | Q | G | I | K | M | C | G | K | E | F | N | K | A | F | E | L | Y | D | Q | D | G | N | G | Y | I | D | E | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | B | S | T | T | T | S | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | |
Sequence | L | D | A | L | L | K | D | L | C | E | K | N | K | Q | E | L | D | I | N | N | I | S | T | Y | K | K | N | I | M | A | L | S | D | G | G | K | L | Y | R | T | D | L | A | L | I | L | S | A | G | D | N | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | S | B | T | T | G | G | G | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|