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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ekeB_ | PDB header: ligase/protein binding | Chain: B: PDB Molecule: sumo-conjugating enzyme ubc9; | PDBTitle: structure of a sumo-binding-motif mimic bound to smt3p-2 ubc9p: conservation of a noncovalent ubiquitin-like3 protein-e2 complex as a platform for selective4 interactions within a sumo pathway |
Added to library: Tue Mar 16 14:08:24 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | C | L | Q | R | L | Q | E | E | R | K | K | W | R | K | D | H | P | F | G | F | Y | A | K | P | V | K | K | A | D | G | S | M | D | L | Q | K | W | E | A | G | I | P | G | K | E | G | T | N | W | A | G | G | V | Y | P | I | T | V | E | Y | P | N | E | Y | P | S | K | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | K | V | K | F | P | A | G | F | Y | H | P | N | V | Y | P | S | G | T | I | C | L | S | I | L | N | E | D | Q | D | W | R | P | A | I | T | L | K | Q | I | V | L | G | V | Q | D | L | L | D | S | P | N | P | N | S | P | A | Q | E | P | A | W | R | S | F | S | R | N | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | S | B | B | G | G | G | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | Y | D | K | K | V | L | L | Q | A | K | Q | Y | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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