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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2dhgA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: trna selenocysteine associated protein (secp43); | PDBTitle: solution structure of the c-terminal rna recognition motif2 in trna selenocysteine associated protein |
Added to library: Tue Mar 16 14:13:56 2010 | |
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Sequence | G | S | S | G | S | S | G | P | E | Y | S | L | F | V | G | D | L | T | P | D | V | D | D | G | M | L | Y | E | F | F | V | K | V | Y | P | S | C | R | G | G | K | V | V | L | D | Q | T | G | V | S | K | G | Y | G | F | V | K | F | T | D | E | L | E | Q | K | R | A | L | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | C | Q | G | A | V | G | L | G | S | K | P | V | R | L | S | V | A | I | P | K | A | S | R | V | K | P | V | E | S | G | P | S | S | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | B | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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