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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2d9oA_ | PDB header: rna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: dnaj (hsp40) homolog, subfamily c, member 17; | PDBTitle: solution structure of rna binding domain in hypothetical2 protein flj10634 |
Added to library: Tue Mar 16 12:47:56 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | G | S | S | G | Q | G | T | P | K | L | K | L | K | W | K | C | K | K | E | D | E | S | K | G | G | Y | S | K | D | V | L | L | R | L | L | Q | K | Y | G | E | V | L | N | L | V | L | S | S | K | K | P | G | T | A | V | V | E | F | A | T | V | K | A | A | E | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | Q | N | E | V | G | L | V | D | N | P | L | K | I | S | W | L | E | G | Q | P | Q | D | A | S | G | P | S | S | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | B | S | S | S | B | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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