|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c2d3o1_ | PDB header: ribosome | Chain: 1: PDB Molecule: trigger factor; | PDBTitle: structure of ribosome binding domain of the trigger factor2 on the 50s ribosomal subunit from d. radiodurans |
Added to library: Tue Mar 16 13:37:55 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | N | K | V | E | F | K | V | S | V | P | A | A | E | V | N | R | A | Y | D | Q | V | W | A | G | L | A | R | D | V | R | V | P | G | F | R | P | G | K | A | P | R | K | V | I | E | N | R | V | G | K | G | Y | V | E | S | Q | V | R | D | R | L | L | E | T | H | Y | S | Q | G | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | T | S | B | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | |||||||||||||||||
Sequence | R | E | L | G | L | N | L | V | D | A | T | V | D | P | Q | D | V | Q | S | G | Q | A | F | E | F | T | V | K | G | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|