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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2cy7A_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: cysteine protease apg4b; | PDBTitle: the crystal structure of human atg4b |
Added to library: Tue Mar 16 12:40:03 2010 | |
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Sequence | T | L | T | Y | D | T | L | R | F | A | E | F | E | D | F | P | E | T | S | E | P | V | W | I | L | G | R | K | Y | S | I | F | T | E | K | D | E | I | L | S | D | V | A | S | R | L | W | F | T | Y | R | K | N | F | P | A | I | G | G | T | G | P | T | S | D | T | G | W | G | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | S | B | S | T | T | T | T | S | S | B | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | L | R | C | G | Q | M | I | F | A | Q | A | L | V | C | R | H | L | G | R | D | W | R | W | T | Q | R | K | R | Q | P | D | S | Y | F | S | V | L | N | A | F | I | D | R | K | D | S | Y | Y | S | I | H | Q | I | A | Q | M | G | V | G | E | G | K | S | I | G | Q | W | Y | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | N | T | V | A | Q | V | L | K | K | L | A | V | F | D | T | W | S | S | L | A | V | H | I | A | M | D | N | T | V | V | M | E | E | I | R | R | L | C | R | T | S | V | P | C | S | P | W | R | P | L | V | L | L | I | P | L | R | L | G | L | T | D | I | N | E | A | Y | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | B | S | S | B | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | L | K | H | C | F | M | M | P | Q | S | L | G | V | I | G | G | K | P | N | S | A | H | Y | F | I | G | Y | V | G | E | E | L | I | Y | L | D | P | H | T | T | Q | P | A | V | E | G | C | F | I | P | D | E | S | F | H | C | Q | H | P | P | C | R | M | S | I | A | E | L | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | G | G | G | B | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . |
Sequence | P | S | I | A | V | G | F | F | C | K | T | E | D | D | F | N | D | W | C | Q | Q | V | K | K | L | S | L | L | P | M | F | E | L | V | E | Q | Q | P | D | V | L | N | L | S | L | D | S | S | D | V | E | R | L | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |
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