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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2cskA_ | PDB header: protein transport | Chain: A: PDB Molecule: sorting nexin 12; | PDBTitle: solution structure of px domain from human snx12 |
Added to library: Tue Mar 16 14:06:30 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | S | G | S | S | G | S | N | F | L | E | I | D | I | F | N | P | Q | T | V | G | V | G | R | A | R | F | T | T | Y | E | V | R | M | R | T | N | L | P | I | F | K | L | K | E | S | C | V | R | R | R | Y | S | D | F | E | W | L | K | N | E | L | E | R | D | S | K | I | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | P | P | L | P | G | K | A | L | K | R | Q | L | P | F | R | G | D | E | G | I | F | E | E | S | F | I | E | E | R | R | Q | G | L | E | Q | F | I | N | K | I | A | G | H | P | L | A | Q | N | E | R | C | L | H | M | F | L | Q | E | E | A | I | D | R | N | Y | V | P | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | G | P | S | S | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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