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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2ccmB_ | PDB header: signaling protein | Chain: B: PDB Molecule: calexcitin; | PDBTitle: x-ray structure of calexcitin from loligo pealeii at 1.8a |
Added to library: Tue Mar 16 13:44:19 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | A | H | Q | L | S | D | F | Q | R | N | K | I | L | R | V | F | N | T | F | Y | D | C | N | H | D | G | V | I | E | W | D | D | F | E | L | A | I | K | K | I | C | N | L | H | S | W | P | T | D | G | K | K | H | N | E | A | R | A | T | L | K | L | I | W | D | G | L | R | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | A | D | E | N | E | D | E | Q | V | T | K | E | E | W | L | K | M | W | A | E | C | V | K | S | V | E | K | G | E | S | L | P | E | W | L | T | K | Y | M | N | F | M | F | D | V | N | D | T | S | G | D | N | I | I | D | K | H | E | Y | S | T | V | Y | M | S | Y | G | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | B | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | ||||
Sequence | K | S | D | C | D | A | A | F | D | T | L | S | D | G | G | K | T | M | V | T | R | E | I | F | A | R | L | W | T | E | Y | F | V | S | N | D | R | G | A | K | G | N | H | L | F | G | T | L | K | L | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T | S | B | T | T | G | G | G | G | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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