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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2cblA_ | PDB header: complex (proto-oncogene/peptide) | Chain: A: PDB Molecule: proto-oncogene cbl; | PDBTitle: n-terminal domain of cbl in complex with its binding site2 on zap-70 |
Added to library: Tue Mar 16 12:30:23 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | G | T | V | D | K | K | M | V | E | K | C | W | K | L | M | D | K | V | V | R | L | C | Q | N | P | K | L | A | L | K | N | S | P | P | Y | I | L | D | L | L | P | D | T | Y | Q | H | L | R | T | I | L | S | R | Y | E | G | K | M | E | T | L | G | E | N | E | Y | F | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | S | S | S | S | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | F | M | E | N | L | M | K | K | T | K | Q | T | I | S | L | F | K | E | G | K | E | R | M | Y | E | E | N | S | Q | P | R | R | N | L | T | K | L | S | L | I | F | S | H | M | L | A | E | L | K | G | I | F | P | S | G | L | F | Q | G | D | T | F | R | I | T | K | A | D | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | E | F | W | R | K | A | F | G | E | K | T | I | V | P | W | K | S | F | R | Q | A | L | H | E | V | H | P | I | S | S | G | L | E | A | M | A | L | K | S | T | I | D | L | T | C | N | D | Y | I | S | V | F | E | F | D | I | F | T | R | L | F | Q | P | W | S | S | L | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | T | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | W | N | S | L | A | V | T | H | P | G | Y | M | A | F | L | T | Y | D | E | V | K | A | R | L | Q | K | F | I | H | K | P | G | S | Y | I | F | R | L | S | C | T | R | L | G | Q | W | A | I | G | Y | V | T | A | D | G | N | I | L | Q | T | I | P | H | N | K | P | L | F | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | A | L | I | D | G | F | R | E | G | F | Y | L | F | P | D | G | R | N | Q | N | P | D | L | T | G | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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