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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c2a1aB_ | PDB header: protein synthesis/transferase | Chain: B: PDB Molecule: interferon-induced, double-stranded rna- | PDBTitle: pkr kinase domain-eif2alpha complex |
Added to library: Tue Mar 16 12:57:40 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | A | H | T | V | D | K | R | F | G | M | D | F | K | E | I | E | L | I | G | S | G | G | F | G | Q | V | F | K | A | K | H | R | I | D | G | K | T | Y | V | I | K | R | V | K | Y | N | N | E | K | A | E | R | E | V | K | A | L | A | K | L | D | H | V | N | I | V | H | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | G | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | C | W | D | G | F | D | Y | D | P | E | T | S | S | R | S | K | T | K | C | L | F | I | Q | M | E | F | C | D | K | G | T | L | E | Q | W | I | E | K | R | R | G | E | K | L | D | K | V | L | A | L | E | L | F | E | Q | I | T | K | G | V | D | Y | I | H | S | K | K | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | R | D | L | K | P | S | N | I | F | L | V | D | T | K | Q | V | K | I | G | D | F | G | L | V | T | S | L | K | N | D | G | K | R | R | S | K | G | T | L | R | Y | M | S | P | E | Q | I | S | S | Q | D | Y | G | K | E | V | D | L | Y | A | L | G | L | I | L | A | E | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | H | V | C | D | T | A | F | E | T | S | K | F | F | T | D | L | R | D | G | I | I | S | D | I | F | D | K | K | E | K | T | L | L | Q | K | L | L | S | K | K | P | E | D | R | P | N | T | S | E | I | L | R | T | L | T | V | W | K | K | |||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | T | S | S | G | G | G | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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