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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1zcaA_ | PDB header: signaling protein | Chain: A: PDB Molecule: g alpha i/12; | PDBTitle: crystal structure of g alpha 12 in complex with gdp, mg2+2 and alf4- |
Added to library: Fri Jan 11 01:30:52 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | L | V | K | I | L | L | L | G | A | G | E | S | G | K | S | T | F | L | K | Q | M | R | I | I | H | G | R | E | F | D | Q | K | A | L | L | E | F | R | D | T | I | F | D | N | I | L | K | G | S | R | V | L | V | D | A | R | D | K | L | G | I | P | W | Q | H | S | E | N | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | H | G | M | F | L | M | A | F | E | N | K | A | G | L | P | V | E | P | A | T | F | Q | L | Y | V | P | A | L | S | A | L | W | R | D | S | G | I | R | E | A | F | S | R | R | S | E | F | Q | L | G | E | S | V | K | Y | F | L | D | N | L | D | R | I | G | Q | L | N | Y | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | P | S | K | Q | D | I | L | L | A | R | K | A | T | K | G | I | V | E | H | D | F | V | I | K | K | I | P | F | K | M | V | D | V | G | G | Q | R | S | Q | R | Q | K | W | F | Q | C | F | D | G | I | T | S | I | L | F | M | V | S | S | S | E | Y | D | Q | V | L | M | E | D | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | T | B | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | R | T | N | R | L | V | E | S | M | N | I | F | E | T | I | V | N | N | K | L | F | F | N | V | S | I | I | L | F | L | N | K | M | D | L | L | V | E | K | V | K | S | V | S | I | K | K | H | F | P | D | F | K | G | D | P | H | R | L | E | D | V | Q | R | Y | L | V | Q | C | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | T | G | G | G | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||
Sequence | D | R | K | R | R | N | R | S | K | P | L | F | H | H | F | T | T | A | I | D | T | E | N | I | R | F | V | F | H | A | V | K | D | T | I | L | Q | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | T | T |
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