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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1za6H_ | PDB header: immune system | Chain: H: PDB Molecule: igg heavy chain; | PDBTitle: the structure of an antitumor ch2-domain-deleted humanized2 antibody |
Added to library: Tue Mar 16 14:20:31 2010 | |
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Sequence | Q | V | Q | L | V | Q | S | G | A | E | V | V | K | P | G | A | S | V | K | I | S | C | K | A | S | G | Y | T | F | T | D | H | A | I | H | W | V | K | Q | N | P | G | Q | R | L | E | W | I | G | Y | F | S | P | G | N | D | D | F | K | Y | N | E | R | F | K | G | K | A | T | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | A | D | T | S | A | S | T | A | Y | V | E | L | S | S | L | R | S | E | D | T | A | V | Y | F | C | T | R | S | L | N | M | A | Y | W | G | Q | G | T | L | V | T | V | S | S | A | S | T | K | G | P | S | V | F | P | L | A | P | S | S | K | S | T | S | G | G | T | A | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | C | L | V | K | D | Y | F | P | E | P | V | T | V | S | W | N | S | G | A | L | T | S | G | V | H | T | F | P | A | V | L | Q | S | S | G | L | Y | S | L | S | S | V | V | T | V | P | S | S | S | L | G | T | Q | T | Y | I | C | N | V | N | H | K | P | S | N | T | K | V | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | T | B | T | T | S | S | S | T | T | T | B | T | T | B | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | K | V | E | P | K | S | C | Q | P | R | E | P | Q | V | Y | T | L | P | P | S | R | D | E | L | T | K | N | Q | V | S | L | T | C | L | V | K | G | F | Y | P | S | D | I | A | V | E | W | E | S | N | G | Q | P | E | N | N | Y | K | T | T | P | P | V | L | D | S | D | G | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | ||||||
Sequence | F | F | L | Y | S | K | L | T | V | D | K | S | R | W | Q | Q | G | N | V | F | S | C | S | V | M | H | E | A | L | H | N | H | Y | T | Q | K | S | L | S | L | S | P | G | K | ||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S |
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