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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1z8rA_ | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: coxsackievirus b4 polyprotein; | PDBTitle: 2a cysteine proteinase from human coxsackievirus b4 (strain2 jvb / benschoten / new york / 51) |
Added to library: Tue Mar 16 11:57:03 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | P | Y | G | H | Q | S | G | A | V | Y | V | G | N | Y | K | V | V | N | R | H | L | A | T | H | V | D | W | Q | N | C | V | W | E | D | Y | N | R | D | L | L | V | S | T | T | T | A | H | G | C | D | T | I | A | R | C | Q | C | T | T | G | V | Y | F | C | A | S | K | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | G | G | G | T | T | T | T | T | S | S | B | B | S | B | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | Y | P | V | S | F | E | G | P | G | L | V | E | V | Q | E | S | E | Y | Y | P | K | R | Y | Q | S | H | V | L | L | A | T | G | F | S | E | P | G | D | A | G | G | I | L | R | C | E | H | G | V | I | G | L | V | T | M | G | G | E | G | V | V | G | F | A | D | V | R | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | B | T | T | B | S | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | W | L | E | D | D | A | M | E | Q | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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