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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1ypzA_ | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: h2-t22 protein; | PDBTitle: immune receptor |
Added to library: Tue Mar 16 11:57:28 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | S | H | S | L | R | Y | F | Y | T | A | V | S | R | P | G | L | G | E | P | W | F | I | I | V | G | Y | V | D | D | M | Q | V | L | R | F | S | S | K | E | E | T | P | R | M | A | P | W | L | E | Q | E | E | A | D | N | W | E | Q | Q | T | R | I | V | T | I | Q | G | Q | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | E | R | N | L | M | T | L | V | H | F | Y | N | K | S | M | D | D | S | H | T | L | Q | W | L | Q | G | C | D | V | E | P | D | R | H | L | C | L | W | Y | N | Q | L | A | Y | D | S | E | D | L | P | T | L | N | E | N | P | S | S | C | T | V | G | N | S | T | V | P | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | G | G | G | T | S | S | S | S | B | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | Q | D | L | K | S | H | C | S | D | L | L | Q | K | Y | L | E | K | G | K | E | R | L | L | R | S | D | P | P | K | A | H | V | T | R | H | P | R | P | E | G | D | V | T | L | R | C | W | A | L | G | F | Y | P | A | D | I | T | L | T | W | Q | L | N | G | E | E | L | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 |
Sequence | D | M | E | L | V | E | T | R | P | A | G | D | G | T | F | Q | K | W | A | A | V | V | V | P | L | G | K | E | Q | S | Y | T | C | H | V | Y | H | E | G | L | P | E | P | L | I | L | R | W | G | G | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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