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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1ylaB_ | PDB header: ligase | Chain: B: PDB Molecule: ubiquitin-conjugating enzyme e2-25 kda; | PDBTitle: ubiquitin-conjugating enzyme e2-25 kda (huntington2 interacting protein 2) |
Added to library: Tue Mar 16 12:27:55 2010 | |
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Sequence | G | S | M | A | N | I | A | V | Q | R | I | K | R | E | F | K | E | V | L | K | S | E | E | T | S | K | N | Q | I | K | V | D | L | V | D | E | N | F | T | E | L | R | G | E | I | A | G | P | P | D | T | P | Y | E | G | G | R | Y | Q | L | E | I | K | I | P | E | T | Y | P | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | P | P | K | V | R | F | I | T | K | I | W | H | P | N | I | S | S | V | T | G | A | I | C | L | D | I | L | K | D | Q | W | A | A | A | M | T | L | R | T | V | L | L | S | L | Q | A | L | L | A | A | A | E | P | D | D | P | Q | D | A | V | V | A | N | Q | Y | K | Q | N | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | B | T | T | T | B | B | G | G | G | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . |
Sequence | E | M | F | K | Q | T | A | R | L | W | A | H | V | Y | A | G | A | P | V | S | S | P | E | Y | T | K | K | I | E | N | L | C | A | M | G | F | D | R | N | A | V | I | V | A | L | S | S | K | S | W | D | V | E | T | A | T | E | L | L | L | S | |||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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