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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1yb2A_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: hypothetical protein ta0852; | PDBTitle: structure of a putative methyltransferase from thermoplasma2 acidophilum. |
Added to library: Tue Mar 16 12:03:48 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | V | I | L | V | S | E | D | E | Y | G | K | F | D | E | S | T | N | S | I | L | V | G | K | X | H | H | L | G | S | R | V | I | E | P | G | D | E | L | I | V | S | G | K | S | F | I | V | S | D | F | S | P | X | Y | F | G | R | V | I | C | G | L | R | P | G | X | D | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | V | G | V | G | S | G | N | X | S | S | Y | I | L | Y | A | L | N | G | K | G | T | L | T | V | V | E | R | D | E | D | N | L | K | K | A | X | D | N | L | S | E | F | Y | D | I | G | N | V | R | T | S | R | S | D | I | A | D | F | I | S | D | Q | X | Y | D | A | V | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | I | P | D | P | W | N | H | V | Q | K | I | A | S | X | X | K | P | G | S | V | A | T | F | Y | L | P | N | F | D | Q | S | E | K | T | V | L | S | L | S | A | S | G | X | H | H | L | E | T | V | E | L | X | K | R | R | I | L | V | R | E | G | A | T | R | P | A | S | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | S | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | G | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | T | H | T | A | F | I | T | F | A | I | K | K | S | G | X | V | Y | R | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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