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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1xx5B_ | PDB header: toxin | Chain: B: PDB Molecule: natrin 1; | PDBTitle: crystal structure of natrin from naja atra snake venom |
Added to library: Tue Mar 16 14:21:24 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | E | S | T | R | R | K | K | K | Q | K | E | I | V | D | L | H | N | S | L | R | R | R | V | S | P | T | A | S | N | M | L | K | M | E | W | Y | P | E | A | A | S | N | A | E | R | W | A | N | T | C | S | L | N | H | S | P | D | N | L | R | V | L | E | G | I | Q | C | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | B | S | S | B | T | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | I | Y | M | S | S | N | A | R | T | W | T | E | I | I | H | L | W | H | D | E | Y | K | N | F | V | Y | G | V | G | A | N | P | P | G | S | V | T | G | H | Y | T | Q | I | V | W | Y | Q | T | Y | R | A | G | C | A | V | S | Y | C | P | S | S | A | W | S | Y | F | Y | V | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | G | G | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | Y | C | P | S | G | N | F | Q | G | K | T | A | T | P | Y | K | L | G | P | P | C | G | D | C | P | S | A | C | D | N | G | L | C | T | N | P | C | T | I | Y | N | K | L | T | N | C | D | S | L | L | K | Q | S | S | C | Q | D | D | W | I | K | S | N | C | P | A | S | C | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | B | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | B | S | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | C | R | N | K | I | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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