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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1x86A_ | PDB header: signaling protein/membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: rho guanine nucleotide exchange factor 12; | PDBTitle: crystal structure of the dh/ph domains of leukemia-2 associated rhogef in complex with rhoa |
Added to library: Tue Mar 16 13:58:05 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | N | W | Q | Q | L | V | S | R | E | V | L | L | G | L | K | P | C | E | I | K | R | Q | E | V | I | N | E | L | F | Y | T | E | R | A | H | V | R | T | L | K | V | L | D | Q | V | F | Y | Q | R | V | S | R | E | G | I | L | S | P | S | E | L | R | K | I | F | S | N | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | D | I | L | Q | L | H | I | G | L | N | E | Q | M | K | A | V | R | K | R | N | E | T | S | V | I | D | Q | I | G | E | D | L | L | T | W | F | S | G | P | G | E | E | K | L | K | H | A | A | A | T | F | C | S | N | Q | P | F | A | L | E | M | I | K | S | R | Q | K | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | R | F | Q | T | F | V | Q | D | A | E | S | N | P | L | C | R | R | L | Q | L | K | D | I | I | P | T | Q | M | Q | R | L | T | K | Y | P | L | L | L | D | N | I | A | K | Y | T | E | W | P | T | E | R | E | K | V | K | K | A | A | D | H | C | R | Q | I | L | N | F | V | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Q | A | V | K | E | A | E | N | K | Q | R | L | E | D | Y | Q | R | R | L | D | T | S | S | L | K | L | S | E | Y | P | N | V | E | E | L | R | N | L | D | L | T | K | R | K | M | I | H | E | G | P | L | V | W | K | V | N | R | D | K | T | I | D | L | Y | T | L | L | L | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | G | G | G | S | G | G | G | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 340 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 350 |
Sequence | I | L | V | L | L | Q | K | Q | D | D | R | L | V | L | R | C | H | S | T | F | S | P | V | I | K | L | S | T | V | L | V | R | Q | V | A | T | D | N | K | A | L | F | V | I | S | M | S | D | N | G | A | Q | I | Y | E | L | V | A | Q | T | V | S | E | K | T | V | W | Q | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | B | S | S | B | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 360 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | C | R | M | A | A | S | V | K | E | Q | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
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