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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1vw4L_ | PDB header: ribosome | Chain: L: PDB Molecule: 54s ribosomal protein l8, mitochondrial; | PDBTitle: structure of the yeast mitochondrial large ribosomal subunit |
Added to library: Sat Apr 12 08:22:54 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | V | G | I | A | R | K | L | S | R | D | K | A | H | R | D | A | L | L | K | N | L | A | C | Q | L | F | Q | H | E | S | I | V | S | T | H | A | K | C | K | E | A | S | R | V | A | E | R | I | I | T | W | T | K | R | A | I | T | T | S | N | S | V | A | Q | A | E | L | K | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | I | Q | S | Q | L | F | L | A | G | D | N | R | K | L | M | K | R | L | F | S | E | I | A | P | R | Y | L | E | R | P | G | G | Y | T | R | V | L | R | L | E | P | R | A | N | D | S | A | P | Q | S | V | L | E | L | V | D | S | P | V | M | S | E | S | H | T | V | N | R | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | L | K | M | W | L | L | V | K | S | V | I | N | D | D | A | N | Q | L | P | H | N | P | L | T | L | Q | N | L | H | K | V | A | K | F | K | A | E | A | Q | L | H | G | E | I | M | L | I | K | Q | V | L | L | K | E | M | S | L | P | Y | D | E | A | L | E | N | E | R | T | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | L | L | K | E | V | Y | S | S | S | S | S | Y | V | M | V | P | R | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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