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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title | 
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| c1vw3D_ | PDB header: ribosome | Chain: D: PDB Molecule: 54s ribosomal protein yml6, mitochondrial; | PDBTitle: structure of the yeast mitochondrial large ribosomal subunit | 
| Added to library: Sat Apr 12 08:23:53 2014 | |
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| Links to external resources | |
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| Sequence | P | L | P | N | A | A | I | P | P | K | Y | A | L | V | T | V | R | S | F | P | S | L | E | P | L | T | F | V | P | V | P | T | S | T | V | A | A | P | L | R | R | D | I | L | W | R | A | V | V | Y | E | N | D | N | R | R | V | G | A | S | N | P | P | G | R | S | E | N | G | F | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S |  |  |  |  |  |  |  | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 | 
| Sequence | S | R | R | K | L | M | P | Q | K | G | S | G | R | A | R | V | G | D | A | N | S | P | T | R | H | N | G | G | R | A | L | A | R | T | A | P | N | D | Y | T | T | E | L | P | S | K | V | Y | S | M | A | F | N | N | A | L | S | H | Q | Y | K | S | G | K | L | F | V | I | G | G | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T |  |  |  |  |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 | 
| Sequence | E | K | V | D | L | I | S | P | T | P | E | L | D | L | N | R | L | D | L | I | F | E | G | E | V | I | F | R | K | F | L | E | E | F | Q | L | K | G | K | R | L | L | F | I | T | D | K | T | R | E | G | L | I | K | S | S | D | P | Y | K | Q | K | V | D | V | I | Q | K | E | L | 
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | S | S | S |  |  |  |  |  | S | S |  |  |  |  |  |  |  | G | G | G | G | G | G |  |  |  |  |  | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 
| Sequence | V | E | V | N | D | I | L | R | A | Q | A | V | F | I | E | L | E | A | L | E | Y | L | A | M | A | H | Q | K | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |  |  |  |  |  |  | S |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | T | 
| Download: | PDB structure | FASTA sequence | 
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