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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1vw3C_ | PDB header: ribosome | Chain: C: PDB Molecule: 54s ribosomal protein l9, mitochondrial; | PDBTitle: structure of the yeast mitochondrial large ribosomal subunit |
Added to library: Sat Apr 12 08:27:20 2014 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | T | R | P | F | L | V | A | P | S | I | A | N | S | I | T | T | E | A | P | A | I | N | H | S | P | E | L | A | N | A | R | K | W | L | P | K | R | C | G | L | I | T | R | K | K | G | M | M | P | Y | F | D | K | S | T | G | E | R | S | A | A | T | I | L | E | V | N | N | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | V | I | M | H | R | T | S | E | V | N | G | Y | F | A | C | Q | V | G | Y | G | S | R | H | L | S | K | V | S | R | Q | M | L | G | H | F | A | S | K | V | V | N | P | K | E | H | V | A | E | F | R | V | K | D | E | K | G | L | I | P | P | G | T | L | L | K | P | S | F | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | G | G | G | T | T | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | G | Q | Y | V | D | V | R | S | V | S | K | G | K | G | F | T | G | V | M | K | R | Y | G | F | K | G | L | R | A | S | H | G | T | S | I | M | H | R | H | G | G | S | Y | G | Q | N | Q | D | P | G | R | V | L | P | G | R | K | M | P | G | H | M | G | N | E | H | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||
Sequence | I | Q | N | V | K | V | L | K | V | D | D | E | N | N | V | I | W | V | K | G | S | V | A | G | P | K | N | S | F | V | K | I | Q | D | A | I | K | K | T | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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