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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1vqzA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: lipoate-protein ligase, putative; | PDBTitle: crystal structure of putative lipoate-protein ligase2 (np_345629.1) from streptococcus pneumoniae tigr4 at 1.993 a resolution |
Added to library: Tue Mar 16 14:09:58 2010 | |
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Sequence | H | X | K | Y | I | I | N | H | S | N | D | T | A | F | N | I | A | L | E | E | Y | A | F | K | H | L | L | D | E | D | Q | I | F | L | L | W | I | N | K | P | S | I | I | V | G | R | H | Q | N | T | I | E | E | I | N | R | D | Y | V | R | E | N | G | I | E | V | V | R | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | G | G | G | T | B | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | G | G | G | A | V | Y | H | D | L | N | N | L | N | Y | T | I | I | S | K | E | D | E | N | K | A | F | D | F | K | S | F | S | T | P | V | I | N | T | L | A | Q | L | G | V | K | A | E | F | T | G | R | N | D | L | E | I | D | G | K | K | F | C | G | N | A | Q | A | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | G | R | I | X | H | H | G | C | L | L | F | D | V | D | L | S | V | L | A | N | A | L | K | V | S | K | D | K | F | E | S | K | G | V | K | S | V | R | A | R | V | T | N | I | I | N | E | L | P | K | K | I | T | V | E | K | F | R | D | L | L | L | E | Y | X | K | K | E | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | B | S | S | S | B | G | G | G | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | E | X | T | E | Y | V | F | S | E | E | E | L | A | E | I | N | R | I | K | D | T | K | F | G | T | W | D | W | N | Y | G | K | S | P | E | F | N | V | R | R | G | I | K | F | T | S | G | K | V | E | V | F | A | N | V | T | E | S | K | I | Q | D | I | K | I | Y | G | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | |||||||
Sequence | F | G | I | E | D | V | A | A | V | E | D | V | L | R | G | V | K | Y | E | R | E | D | V | L | K | A | L | K | T | I | D | I | T | R | Y | F | A | G | I | S | R | E | E | I | A | E | A | V | V | G | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | B | S | S | T | T | S | G | G | G | T | S | T | T |
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