|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1v8jA_ | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: kinesin-like protein kif2c; | PDBTitle: the crystal structure of the minimal functional domain of2 the microtubule destabilizer kif2c complexed with mg-adp |
Added to library: Tue Mar 16 11:58:06 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | N | W | E | F | A | R | M | I | K | E | F | R | V | T | M | E | C | S | P | L | T | P | I | E | E | H | R | I | C | V | C | V | R | K | R | P | L | N | K | Q | E | L | A | K | K | E | I | D | V | I | S | V | P | S | K | C | L | L | L | V | H | E | P | K | L | K | V | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | B | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | K | Y | L | E | N | Q | A | F | C | F | D | F | A | F | D | E | T | A | S | N | E | V | V | Y | R | F | T | A | R | P | L | V | Q | T | I | F | E | G | G | K | A | T | C | F | A | Y | G | Q | T | G | S | G | K | T | H | T | M | G | G | D | Q | N | A | S | K | G | I | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | M | A | S | R | D | V | F | L | L | K | N | Q | P | R | Y | R | N | L | N | L | E | V | Y | V | T | F | F | E | I | Y | N | G | K | V | F | D | L | L | N | K | K | A | K | L | R | V | L | E | D | S | R | Q | Q | V | Q | V | V | G | L | Q | E | Y | L | V | T | C | A | D | D | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | I | K | M | I | N | M | G | S | A | C | R | T | S | G | N | S | N | S | S | R | S | H | A | C | F | Q | I | L | L | R | T | K | G | R | L | H | G | K | F | S | L | V | D | L | A | G | N | E | R | R | Q | T | R | M | E | G | A | E | I | N | K | S | L | L | A | L | K | E | C | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | A | L | G | Q | F | R | E | S | K | L | T | Q | V | L | R | D | S | F | I | G | E | N | S | R | T | C | M | I | A | M | I | S | P | G | I | S | S | C | E | Y | T | L | N | T | L | R | Y | A | D | R | V | K | E | L | S | H | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | B | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|