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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1uruA_ | PDB header: endocytosis | Chain: A: PDB Molecule: amphiphysin; | PDBTitle: amphiphysin bar domain from drosophila |
Added to library: Tue Mar 16 13:22:37 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | N | L | G | K | V | D | R | T | A | D | E | I | F | D | D | H | L | N | N | F | N | R | Q | Q | A | S | A | N | R | L | Q | K | E | F | N | N | Y | I | R | C | V | R | A | A | Q | A | A | S | K | T | L | X | D | S | V | C | E | I | Y | E | P | Q | W | S | G | Y | D | A | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | A | Q | T | G | A | S | E | S | L | W | A | D | F | A | H | K | L | G | D | Q | V | L | I | P | L | N | T | Y | T | G | Q | F | P | E | X | K | K | K | V | E | K | R | N | R | K | L | I | D | Y | D | G | Q | R | H | S | F | Q | N | L | Q | A | N | A | N | K | R | K | D | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | B | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | V | K | L | T | K | G | R | E | Q | L | E | E | A | R | R | T | Y | E | I | L | N | T | E | L | H | D | E | L | P | A | L | Y | D | S | R | I | L | F | L | V | T | N | L | Q | T | L | F | A | T | E | Q | V | F | H | N | E | T | A | K | I | Y | S | E | L | E | A | I | V | D | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | A | T | E | S | Q | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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