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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1u53A_ | PDB header: antibiotic | Chain: A: PDB Molecule: secreted protein asp-2; | PDBTitle: novel x-ray structure of na-asp-2, a pr-1 protein from the2 nematode parasite necator americanus and a vaccine antigen3 for human hookworm infection |
Added to library: Tue Mar 16 12:33:19 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | G | C | P | D | N | G | M | S | E | E | A | R | Q | K | F | L | E | M | H | N | S | L | R | S | S | V | A | L | G | Q | A | K | D | G | A | G | G | N | A | P | K | A | A | K | M | K | T | M | A | Y | D | C | E | V | E | K | T | A | M | N | N | A | K | Q | C | V | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | T | T | S | S | B | B | S | S | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | S | Q | P | N | Q | R | K | G | L | G | E | N | I | F | M | S | S | D | S | G | M | D | K | A | K | A | A | E | Q | A | S | K | A | W | F | G | E | L | A | E | K | G | V | G | Q | N | L | K | L | T | G | G | L | F | S | R | G | V | G | H | Y | T | Q | M | V | W | Q | E | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | S | B | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . |
Sequence | V | K | L | G | C | Y | V | E | A | C | S | N | M | C | Y | V | V | C | Q | Y | G | P | A | G | N | M | M | G | K | D | I | Y | E | K | G | E | P | C | S | K | C | E | N | C | D | K | E | K | G | L | C | S | A | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | B | S | S | B | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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