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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1u4fD_ | PDB header: allergen | Chain: D: PDB Molecule: inward rectifier potassium channel 2; | PDBTitle: crystal structure of cytoplasmic domains of irk1 (kir2.1)2 channel |
Added to library: Tue Mar 16 12:04:18 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | R | F | V | K | K | D | G | H | C | N | V | Q | F | I | N | V | G | E | K | T | L | V | F | S | H | N | A | V | I | A | M | R | D | G | K | L | C | L | M | W | R | V | G | N | L | R | K | S | H | L | V | E | A | H | V | R | A | Q | L | L | K | S | R | I | T | S | E | G | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | T | T | S | B | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | I | P | L | D | Q | I | D | I | N | V | G | F | D | S | G | I | D | R | I | F | L | V | S | P | I | T | I | V | H | E | I | D | E | D | S | P | L | Y | D | L | S | K | Q | D | I | D | N | A | D | F | E | I | V | V | I | L | E | G | M | V | E | A | T | A | M | T | T | Q | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | T | T | T | B | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | S | S | Y | L | A | N | E | I | L | W | G | H | R | Y | E | P | V | L | F | E | E | K | H | Y | Y | K | V | D | Y | S | R | F | H | K | T | Y | E | V | P | N | T | P | L | C | S | A | R | D | L | A | E | K | K | Y | I | L | |||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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