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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1txlA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: metal-binding protein yoda; | PDBTitle: crystal structure of metal-binding protein yoda from e.2 coli, pfam duf149 |
Added to library: Tue Mar 16 12:50:37 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | G | K | P | L | T | E | V | E | Q | K | A | A | N | G | V | F | D | D | A | N | V | Q | N | R | T | L | S | D | W | D | G | V | W | Q | S | V | Y | P | L | L | Q | S | G | K | L | D | P | V | F | Q | K | K | A | D | A | D | K | T | K | T | F | A | E | I | K | D | Y | Y | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | G | G | G | G | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | G | Y | A | T | D | I | E | M | I | G | I | E | D | G | I | V | E | F | H | R | N | N | E | T | T | S | C | K | Y | D | Y | D | G | Y | K | I | L | T | Y | K | S | G | K | K | G | V | R | Y | L | F | E | C | K | D | P | E | S | K | A | P | K | Y | I | Q | F | S | D | H | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | I | A | P | R | K | S | S | H | F | H | I | F | M | G | N | D | S | Q | Q | S | L | L | N | E | M | E | N | W | P | T | Y | Y | P | Y | Q | L | S | S | E | E | V | V | E | E | M | M | S | H | ||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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