|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1tlwA_ | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: nucleoside-specific channel-forming protein tsx; | PDBTitle: tsx structure complexed with thymidine |
Added to library: Thu Jan 10 07:46:17 2013 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | L | S | D | W | W | H | Q | S | V | N | V | V | G | S | Y | H | T | R | F | G | P | Q | I | R | N | D | T | Y | L | E | Y | E | A | F | A | K | K | D | W | F | D | F | Y | G | Y | A | D | A | P | V | P | L | F | M | E | I | E | P | R | F | S | I | D | K | L | T | N | T | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | B | S | S | S | S | B | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | F | G | P | F | K | E | W | Y | F | A | N | N | Y | I | Y | D | M | G | R | N | K | D | G | R | Q | S | T | W | Y | M | G | L | G | T | D | I | D | T | G | L | P | M | S | L | S | M | N | V | Y | A | K | Y | Q | W | Q | N | Y | G | A | A | N | E | N | E | W | D | G | Y | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | K | I | K | Y | F | V | P | I | T | D | L | W | G | G | Q | L | S | Y | I | G | F | T | N | F | D | W | G | S | D | L | G | D | D | S | G | N | A | I | N | G | I | K | T | R | T | N | N | S | I | A | S | S | H | I | L | A | L | N | Y | D | H | W | H | Y | S | V | V | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | S | B | T | T | S | S | B | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | |||||||||
Sequence | Y | W | H | D | G | G | Q | W | N | D | D | A | E | L | N | F | G | N | G | N | F | N | V | R | S | T | G | W | G | G | Y | L | V | V | G | Y | N | F | H | H | H | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | B | T | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|