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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1tljA_ | PDB header: structural genomics, unknown function | Chain: A: PDB Molecule: hypothetical upf0130 protein sso0622; | PDBTitle: crystal structure of conserved protein of unknown function2 sso0622 from sulfolobus solfataricus |
Added to library: Tue Mar 16 13:28:44 2010 | |
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Sequence | L | V | W | E | E | L | R | E | K | A | L | N | K | I | Y | H | D | K | E | I | G | Y | L | D | P | D | I | L | G | F | L | L | A | F | Y | R | N | R | N | D | V | Y | T | Q | S | S | C | S | G | R | I | T | I | V | D | A | E | M | P | W | D | R | K | N | S | T | I | I | F | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | H | L | R | I | T | E | Q | D | L | E | D | V | L | S | K | N | Q | V | R | R | L | W | L | I | V | Q | G | P | I | I | H | I | Y | A | K | N | I | E | T | G | W | D | I | L | K | I | A | R | E | A | G | F | K | H | S | G | I | L | A | T | N | Q | K | G | V | L | V | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||
Sequence | R | T | G | I | R | M | V | H | L | L | R | E | S | N | T | E | R | V | D | K | D | K | I | K | T | L | V | N | V | C | N | E | V | L | A | R | G | K | Q | K | M | N | L | L | K | D | L | L | S | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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