|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c1t7wA_ | PDB header: lipid binding protein | Chain: A: PDB Molecule: zinc-alpha-2-glycoprotein; | PDBTitle: zn-alpha-2-glycoprotein; cho-zag peg 400 |
Added to library: Tue Mar 16 13:20:51 2010 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | D | G | R | Y | S | L | T | Y | I | Y | T | G | L | S | K | H | V | E | D | V | P | A | F | Q | A | L | G | S | L | N | D | L | Q | F | F | R | Y | N | S | K | D | R | K | S | Q | P | M | G | L | W | R | Q | V | E | G | M | E | D | W | K | Q | D | S | Q | L | Q | K | A | R | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | G | G | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | I | F | M | E | T | L | K | D | I | V | E | Y | Y | K | D | S | T | G | S | H | V | L | Q | G | R | F | G | C | E | I | E | N | N | R | S | S | G | A | F | W | K | Y | Y | Y | D | G | K | D | Y | I | E | F | N | K | E | I | P | A | W | V | P | F | D | P | A | A | Q | I | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | Q | K | W | E | A | E | P | V | Y | V | Q | R | A | K | A | Y | L | E | E | E | C | P | A | T | L | R | K | Y | L | K | Y | S | K | N | I | L | D | R | Q | D | P | P | S | V | V | V | T | S | H | Q | A | P | G | E | K | K | K | L | K | C | L | A | Y | D | F | Y | P | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | I | D | V | H | W | T | R | A | G | E | V | Q | E | P | E | L | R | G | D | V | L | H | N | G | N | G | T | Y | Q | S | W | V | V | V | A | V | P | P | Q | D | T | A | P | Y | S | C | H | V | Q | H | S | S | L | A | Q | P | L | V | V | P | W | E | A | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|