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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1sy6A_ | PDB header: signaling protein/antibiotic | Chain: A: PDB Molecule: t-cell surface glycoprotein cd3 gamma/epsilon | PDBTitle: crystal structure of cd3gammaepsilon heterodimer in complex2 with okt3 fab fragment |
Added to library: Tue Mar 16 13:18:30 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | Q | S | I | K | G | N | H | L | V | K | V | Y | D | Y | Q | E | D | G | S | V | L | L | T | C | D | A | E | A | K | N | I | T | W | F | K | D | G | K | M | I | G | F | L | T | E | D | K | K | K | W | N | L | G | S | N | A | K | D | P | R | G | M | Y | Q | C | K | G | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | K | S | K | P | L | Q | V | Y | Y | R | M | Q | T | P | Y | K | V | S | I | S | G | T | T | V | I | L | T | C | P | Q | Y | P | G | S | E | I | L | W | Q | H | N | D | K | N | I | G | G | D | E | D | D | K | N | I | G | S | D | E | D | H | L | S | L | K | E | F | S | E | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | Q | S | G | Y | Y | V | C | Y | P | R | G | S | K | P | E | D | A | N | F | Y | L | Y | L | R | A | R | V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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