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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1skxA_ | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: orphan nuclear receptor pxr; | PDBTitle: structural disorder in the complex of human pxr and the2 macrolide antibiotic rifampicin |
Added to library: Wed Jan 9 17:49:00 2013 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | T | E | E | Q | R | M | M | I | R | E | L | M | D | A | Q | M | K | T | F | D | T | T | F | S | H | F | K | N | F | R | L | P | G | V | K | V | S | L | Q | L | R | G | E | D | G | S | V | W | N | Y | K | P | P | I | F | S | L | L | P | H | M | A | D | M | S | T | Y | M | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | G | I | I | S | F | A | K | V | I | S | Y | F | R | D | L | P | I | E | D | Q | I | S | L | L | K | G | A | A | F | E | L | C | Q | L | R | F | N | T | V | F | N | A | E | T | G | T | W | E | C | G | R | L | S | Y | C | L | E | L | L | L | E | P | M | L | K | F | H | Y | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | K | K | L | Q | L | H | E | E | E | Y | V | L | M | Q | A | I | S | L | F | S | P | D | R | P | G | V | L | Q | H | R | V | V | D | Q | L | Q | E | Q | F | A | I | T | L | K | S | Y | I | E | C | N | R | P | Q | P | A | H | R | F | L | F | L | K | I | M | A | M | L | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | |||||||||||||||||||||||
Sequence | L | R | S | I | N | A | Q | H | T | Q | R | L | L | R | I | Q | D | I | H | P | F | A | T | P | L | M | Q | E | L | F | G | I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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