 |
| |||||
| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 | ||||||
|
|
|
| |||||
| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 | ||||||
|
| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
|---|---|---|---|
| c1s1iN_ | PDB header: ribosome | Chain: N: PDB Molecule: 60s ribosomal protein l17-a; | PDBTitle: structure of the ribosomal 80s-eef2-sordarin complex from2 yeast obtained by docking atomic models for rna and protein3 components into a 11.7 a cryo-em map. this file, 1s1i,4 contains 60s subunit. the 40s ribosomal subunit is in file5 1s1h. |
| Added to library: Tue Mar 16 12:11:23 2010 | |
| Links to external resources | |
|---|---|
 |  |
| 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 | |
| Sequence | A | T | S | T | N | P | A | K | S | A | S | A | R | G | S | Y | L | R | V | S | F | K | N | T | R | E | T | A | Q | A | I | N | G | W | E | L | T | K | A | Q | K | Y | L | E | Q | V | L | D | H | Q | R | A | I | P | F | R | R | F | N | S | S | I | G | R | T | A | Q | G | K | E |
| Predicted secondary structure |  | | | | | |  |  | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | |||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | | | | | | T | S | S | | | S | S | S | S | S | G | G | G | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
| Sequence | F | G | V | T | K | A | R | W | P | A | K | S | V | K | F | V | Q | G | L | L | Q | N | A | A | A | N | A | E | A | K | G | L | D | A | T | K | L | Y | V | S | H | I | Q | V | N | Q | A | P | K | Q | R | R | R | T | Y | R | A | H | G | R | I | N | K | Y | E | S | S | P | S | H |
| Predicted secondary structure | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | | | B | T | T | B | S | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | | | | | S | S | S | S | S | S | B | S | S | S | B | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
| Sequence | I | E | L | V | V | T | E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure | | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) |
| Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
| |||||||||||||||||||||||
