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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 | |||||||
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| Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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| c1s1iM_ | PDB header: ribosome | Chain: M: PDB Molecule: 60s ribosomal protein l16-a; | PDBTitle: structure of the ribosomal 80s-eef2-sordarin complex from2 yeast obtained by docking atomic models for rna and protein3 components into a 11.7 a cryo-em map. this file, 1s1i,4 contains 60s subunit. the 40s ribosomal subunit is in file5 1s1h. |
| Added to library: Tue Mar 16 12:38:00 2010 | |
| Links to external resources | |
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| Sequence | S | V | E | P | V | V | V | I | D | G | K | G | H | L | V | G | R | L | A | S | V | V | A | K | Q | L | L | N | G | Q | K | I | V | V | V | R | A | E | E | L | N | I | S | G | E | F | F | R | N | K | L | K | Y | H | D | F | L | R | K | A | T | A | F | N | K | T | R | G | P | F |
| Predicted secondary structure |  | | | | |  | | |  | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | B | | | | | T | T | T | T | T | T | | | | | T | | | | | S | S | B | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T | S | T | T | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
| Sequence | H | F | R | A | P | S | R | I | F | Y | K | A | L | R | G | M | V | S | H | K | T | A | R | G | K | A | A | L | E | R | L | K | V | F | E | G | I | P | P | P | Y | D | K | K | K | R | V | V | V | P | Q | A | L | R | V | L | R | L | K | P | G | R | K | Y | T | T | L | G | K | L |
| Predicted secondary structure | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Known secondary structure (DSSP) | S | | | | | | | | | | | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | | | | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | S | S | S | T | T | | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||
| Sequence | S | T | S | V | G | W | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted secondary structure | | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Known secondary structure (DSSP) | | | | S |
| Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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