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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1r19B_ | PDB header: cell adhesion | Chain: B: PDB Molecule: fibrinogen-binding protein sdrg; | PDBTitle: crystal structure analysis of s.epidermidis adhesin sdrg2 binding to fibrinogen (apo structure) |
Added to library: Tue Mar 16 13:04:33 2010 | |
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Sequence | S | N | V | N | H | L | I | K | V | T | D | Q | S | I | T | E | G | Y | D | D | S | D | G | I | I | K | A | H | D | A | E | N | L | I | Y | D | V | T | F | E | V | D | D | K | V | K | S | G | T | M | T | V | N | I | D | K | N | T | V | P | S | D | L | T | D | S | F | A | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | B | S | S | S | T | T | T | T | T | T | B | S | S | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | I | K | D | N | S | G | E | I | I | A | T | G | T | Y | D | N | T | N | K | Q | I | T | Y | T | F | T | Y | E | N | I | K | A | H | L | K | L | T | S | Y | I | D | K | S | K | V | P | N | N | N | T | K | L | D | V | E | Y | K | T | A | L | S | S | V | N | K | T | I | T | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | E | Y | Q | K | P | N | E | N | R | T | A | N | L | Q | S | M | F | T | N | I | D | T | K | N | H | T | V | E | Q | T | I | Y | I | N | P | L | R | Y | S | A | K | E | T | N | V | N | I | S | G | N | G | D | E | G | S | T | I | I | D | D | S | T | I | I | K | V | Y | K | V | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | S | T | T | B | S | S | B | B | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | D | N | Q | N | L | P | D | S | N | R | I | Y | D | Y | S | E | Y | E | D | V | T | N | D | D | Y | A | Q | L | G | N | N | N | D | V | N | I | N | F | G | N | I | D | S | P | Y | I | I | K | V | I | S | K | Y | D | P | N | K | Y | T | T | I | Q | Q | T | V | T | M | Q | T | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | N | E | Y | T | G | E | F | R | T | A | S | Y | D | N | T | I | A | F | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T |
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