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  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c1qokA_ | PDB header: immunoglobulin | Chain: A: PDB Molecule: mfe-23 recombinant antibody fragment; | PDBTitle: mfe-23 an anti-carcinoembryonic antigen single-chain fv2 antibody |
Added to library: Tue Mar 16 13:52:25 2010 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | K | L | Q | Q | S | G | A | E | L | V | R | S | G | T | S | V | K | L | S | C | T | A | S | G | F | N | I | K | D | S | Y | M | H | W | L | R | Q | G | P | E | Q | G | L | E | W | I | G | W | I | D | P | E | N | G | D | T | E | Y | A | P | K | F | Q | G | K | A | T | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | T | T | T | T | G | G | G | B | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | T | D | T | S | S | N | T | A | Y | L | Q | L | S | S | L | T | S | E | D | T | A | V | Y | Y | C | N | E | G | T | P | T | G | P | Y | Y | F | D | Y | W | G | Q | G | T | T | V | T | V | S | S | E | N | V | L | T | Q | S | P | A | I | M | S | A | S | P | G | E | K | V | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | T | C | S | A | S | S | S | V | S | Y | M | H | W | F | Q | Q | K | P | G | T | S | P | K | L | W | I | Y | S | T | S | N | L | A | S | G | V | P | A | R | F | S | G | S | G | S | G | T | S | Y | S | L | T | I | S | R | M | E | A | E | D | A | A | T | Y | Y | C | Q | Q | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | S | Y | P | L | T | F | G | A | G | T | K | L | E | L | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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